Am Lehrstuhl für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse der Fakult?t für Angewandte Informatik der Universit?t Augsburg ist zum n?chstm?glichen Zeitpunkt die Stelle für eine/einen

Akademische Oberr?tin / Akademischen Oberrat (m/w/d) auf Zeit als
Leitung Serviceeinheit - Einzelzell-RNA-Sequenzierungen
?

im Umfang der regelm??igen Arbeitszeit in einem für vier Jahre befristeten Beamtenverh?ltnis zu besetzen. Die Besoldung erfolgt bei Vorliegen der beamten- und laufbahnrechtlichen Voraussetzungen in Besoldungsgruppe A14, m?glicherweise auch in Teilzeit.

Die Forschung am Lehrstuhl für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse zielt darauf ab, quantitative Systemmodelle mit KI/Machine Learning zu verknüpfen, um neuartige therapeutische Strategien für die Krebs und andere Krankheiten zu entdecken. Mit einem Fokus auf Deep-Learning-Techniken streben wir an, gro? angelegte Datens?tze nahtlos mit Patientenergebnissen zu integrieren, um dadurch komplexe Krankheitsdynamiken und therapeutische Reaktionen zu entschlüsseln. Dabei verwenden wir innovative Technologien wie Einzelzellsequenzierung und Deep Learning, um die Komplexit?t der Krankheitsbiologie zu entr?tseln und klinisch relevante Erkenntnisse zu gewinnen.

Die Serviceeinheit - Einzelzell-RNA-Sequenzierungen leistet digitale Analysearbeit, d.h. Einbringung, Prozessierung und Annotierung von Datens?tzen aus Einzelzell-RNA-Sequenzierungen, wie sie z.B. im Profilzentrum Tumormedizin generiert werden oder in interdisziplin?rer Verbundprojekte mit anderen klinischen Profilzentren durchgeführt werden.

Wir f?rdern die interdisziplin?re Zusammenarbeit durch offene Kommunikation und Karriereplanung, um sicherzustellen, dass Wissenschaftler aus verschiedenen Bereichen produktiv zusammenarbeiten k?nnen.

Ihr Aufgabengebiet:

• Aufbau und Leitung der Serviceeinheit - Einzelzell-RNA-Sequenzierungen
• Aufbau einer computergestützten Infrastruktur, die der nachhaltigen Datenanalyse und auch der Entwicklung von Tools und Methoden dient, die Speicherung gro?er Datens?tze und die gleichzeitige Abfrage mehrerer Datens?tze und biomedizinische Datenanalysen erm?glicht.
• Interne und externe Repr?sentation und Bewerbung der Serviceeinheit, Verwaltung des Webauftrittes und externer Serviceprovider, und idealerweise Mithilfe bei der Einwerbung zus?tzlicher Drittmittelfinanzierung.
• Koordination von Projektsupport, nach Bedarf sowie die Unterstützung technischer Projektberichte, nach Bedarf.?
• Teilnahme an der Erstellung hochwertiger wissenschaftlicher und/ oder technischer Arbeiten, die für die Ver?ffentlichung in renommierten Fachzeitschriften und für die Pr?sentation auf nationalen und internationalen Konferenzen geeignet sind.
• Coaching, Mentoring und direkte Anleitung von technischem Personal, Studierenden und Nachwuchswissenschaftlern zum Import, Bereinigung und Integration von Datens?tzen für computergestützte Analysen, Mithilfe beim Team Building
• Sie halten sich über neu ver?ffentlichte Methoden des Machine Learnings und der Einzelzell-RNA-Sequenzierungen auf dem Laufenden.
• Planen und Durchführen von Lehrveranstaltungen und Unterstützung der Aufgaben der akademischen Selbstverwaltung des Lehrstuhls, gem?? BayHIG.

Ihr Profil:

• Eine abgeschlossene Habilitation oder gleichwertige Qualifikationen in relevanten Themenbereichen wie zum Beispiel Systems Biology, Computational Biology, Data Science, Physik, Informatik, Ingenieurwesen, Statistik, Mathematik.
• Ein Nachweis wissenschaftlicher Innovation und Kreativit?t sowie die F?higkeit und Bereitschaft, neuartige Ideen und Ans?tze in wissenschaftliche Untersuchungen einzubeziehen, idealerweise durch entsprechende Publikationen belegt.
• Vorzugsweise Erfahrung in der Analyse von Bulk- und single-cell RNA Sequencing, dem Aufbau, der Bewertung und dem Einsatz von Deep-Learning-Modellen (Autoencoder, GANs, etc.) die durch abgeschlossene Projekte nachgewiesen werden. Sicherheit bei der Durchführung von computergestützten Analysen, Fehlerbehebung und Dokumentation.
• Programmierkenntnisse, zum Beispiel mit Python (bevorzugt), MATLAB oder R, solide Kenntnis der Best Practice für Programmierung.
• Sehr gute schriftliche und mündliche Kommunikationsf?higkeiten in Englisch, einschlie?lich der F?higkeit, Forschungsergebnisse zu ver?ffentlichen, Berichte zu erstellen und die Ergebnisse wissenschaftlicher Untersuchungen auf nationalen und internationalen Konferenzen und Stakeholder-Treffen zu pr?sentieren.
• Die F?higkeit, als Teil eines multidisziplin?ren Forschungsteams sowie mit externen Forschern, auch international, effektiv zu arbeiten und unabh?ngige individuelle Forschung durchzuführen, um zu gemeinsamen Forschungszielen der Arbeitsgruppe und des Projektteams beizutragen
• Aufgeschlossenheit, Teamf?higkeit, Flexibilit?t sowie die F?higkeit zu selbstst?ndigem und eigenverantwortlichem Arbeiten
• Loyalit?t, Verl?sslichkeit und hohe Vertrauenswürdigkeit
• sicherer Umgang mit Internet, E-Mail und den aktuellen Office-Anwendungen (Word, PowerPoint, Excel) sowie die Bereitschaft, sich hier weiterzubilden

Wir bieten:

• einen attraktiven und sicheren Arbeitsplatz,
• ein interessantes und abwechslungsreiches Aufgabengebiet im dynamischen, multikulturellen Umfeld einer Universit?t,
• M?glichkeiten zu eigenst?ndigem Arbeiten und der Leitungsfunktion in einem engagierten Team,
• eine offene und wertsch?tzende Arbeitsatmosph?re mit pers?nlichem Arbeitsplatz,
• eine familienfreundliche Arbeitszeitgestaltung mit Homeofficeregelungen und gleitenden Arbeitszeiten,
• umfangreiche F?rderung von Fort- und Weiterbildungsm?glichkeiten,
• Jahressonderzahlungen und
• die M?glichkeit, verschiedene universit?re Einrichtungen zu nutzen (z.B. Hochschulsport, Gesundheitsf?rderung, Sprachkurse)

Die erforderliche Qualifikation ist bereits in den Bewerbungsunterlagen durch entsprechende Zeugnisse nachzuweisen.

Die Universit?t Augsburg f?rdert die berufliche Gleichstellung von Frauen. Frauen werden ausdrücklich aufgefordert, sich zu bewerben. Die Universit?t Augsburg setzt sich besonders für die Vereinbarkeit von Familie und Erwerbsleben ein. Für mehr Informationen wenden Sie sich bitte an die Frauenbeauftragte der Fakult?t.

Schwerbehinderte Bewerberinnen und Bewerber (m/w/d) werden bei ansonsten im Wesentlichen gleicher Eignung, Bef?higung und fachlicher Leistung bevorzugt eingestellt.

Haben wir Ihr Interesse geweckt? Dann freuen wir uns über Ihre aussagekr?ftigen Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben, Lebenslauf) bitte nur per E-Mail in Form einer einzigen PDF-Datei bitte bis sp?testens

31. September 2024

an:
Prof. Dr. Andreas Raue
Professur für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse
Universit?t Augsburg
Gutenbergstr. 7
86356 Neus??
E-Mail: andreas.raue@uni-a.de